目前臨床治療腦癱的藥物品種還相對較少，暫時沒有特效藥。目前應用的藥物并不能從根本上恢復腦損害，對癥狀的控制作用有限且不穩定，同時副作用也頗多。藥物治療可提高其他各項治療的效果，但不應作為唯一的方法。

1. 促進腦損傷修復和發育的藥物：維生素、微量元素、必需脂肪酸;氨基酸、肽類、蛋白質。

2.腦細胞活化劑：如腦活素、腦神經生長素、腦復康等。

3.改善運動障礙的藥物：

(1)降低肌張力藥：苯二氮卓類、氯苯氨丁酸、硝苯夫海因;

(2)控制不自主運動和震顫等錐體外系癥狀的藥：安坦、美多巴。

4.行為異常的治療藥物：對注意力缺陷，可使用利他林、右旋苯丙氨;抑郁型行為可使用抗抑郁藥;躁狂型行為可用氯丙嗪、氟哌啶醇。此類藥物都有嚴重的依賴性。

5.肉毒桿菌毒素A：局部注射可緩解肌肉痙攣。肉毒桿菌毒素是由于麻痹了肌肉使肌肉痙攣緩解，所以偶爾會產生頭痛、過敏、復視等不良反應。